MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE02

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010724	A	6	6	132	137	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
2	NC_010724	A	7	7	146	152	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
3	NC_010724	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
4	NC_010724	A	6	6	292	297	100 %	0 %	0 %	0 %	188587526
5	NC_010724	TCC	2	6	303	308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188587526
6	NC_010724	TTCC	2	8	311	318	0 %	50 %	0 %	50 %	188587526
7	NC_010724	AGC	2	6	320	325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188587526
8	NC_010724	GAAA	2	8	359	366	75 %	0 %	25 %	0 %	188587526
9	NC_010724	ATAAA	2	10	385	394	80 %	20 %	0 %	0 %	188587526
10	NC_010724	AGA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
11	NC_010724	AAG	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
12	NC_010724	ACC	2	6	450	455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188587526
13	NC_010724	GAAA	2	8	465	472	75 %	0 %	25 %	0 %	188587526
14	NC_010724	ATT	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587526
15	NC_010724	GA	3	6	539	544	50 %	0 %	50 %	0 %	188587526
16	NC_010724	AGT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587526
17	NC_010724	GA	3	6	666	671	50 %	0 %	50 %	0 %	188587526
18	NC_010724	CG	3	6	817	822	0 %	0 %	50 %	50 %	188587526
19	NC_010724	ATA	2	6	840	845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587526
20	NC_010724	GAG	2	6	902	907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587526
21	NC_010724	AT	3	6	926	931	50 %	50 %	0 %	0 %	188587526
22	NC_010724	AGA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587526
23	NC_010724	AAT	2	6	993	998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587526
24	NC_010724	AGT	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587526
25	NC_010724	A	6	6	1128	1133	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
26	NC_010724	A	7	7	1146	1152	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
27	NC_010724	GA	3	6	1199	1204	50 %	0 %	50 %	0 %	188587527
28	NC_010724	AGA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587527
29	NC_010724	A	6	6	1275	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
30	NC_010724	A	6	6	1284	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
31	NC_010724	TAAGTA	2	12	1316	1327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188587527
32	NC_010724	A	6	6	1344	1349	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
33	NC_010724	CAA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587527
34	NC_010724	A	7	7	1429	1435	100 %	0 %	0 %	0 %	188587527
35	NC_010724	AAT	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587527
36	NC_010724	GAT	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188587527
37	NC_010724	TCA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587527
38	NC_010724	CAG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188587527
39	NC_010724	TCA	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587528
40	NC_010724	AG	3	6	1842	1847	50 %	0 %	50 %	0 %	188587528
41	NC_010724	ATT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587528
42	NC_010724	TTTA	2	8	1918	1925	25 %	75 %	0 %	0 %	188587528
43	NC_010724	TA	3	6	1972	1977	50 %	50 %	0 %	0 %	188587528
44	NC_010724	AAC	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587528
45	NC_010724	GGT	2	6	2137	2142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587528
46	NC_010724	TAA	2	6	2154	2159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587528
47	NC_010724	TAT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587528
48	NC_010724	AAC	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587528
49	NC_010724	AGG	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587528
50	NC_010724	AGA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
51	NC_010724	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587529
52	NC_010724	GTG	2	6	2691	2696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587529
53	NC_010724	AT	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	188587529
54	NC_010724	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
55	NC_010724	A	6	6	2796	2801	100 %	0 %	0 %	0 %	188587529
56	NC_010724	AGA	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
57	NC_010724	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
58	NC_010724	AGA	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
59	NC_010724	ACAA	2	8	2926	2933	75 %	0 %	0 %	25 %	188587529
60	NC_010724	AGA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587529
61	NC_010724	ATA	2	6	2991	2996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587529
62	NC_010724	A	6	6	3009	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	188587529
63	NC_010724	A	8	8	3228	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
64	NC_010724	A	7	7	3263	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
65	NC_010724	ACT	2	6	3278	3283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587530
66	NC_010724	A	6	6	3375	3380	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
67	NC_010724	GAAA	2	8	3393	3400	75 %	0 %	25 %	0 %	188587530
68	NC_010724	AGA	2	6	3401	3406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587530
69	NC_010724	A	6	6	3411	3416	100 %	0 %	0 %	0 %	188587530
70	NC_010724	GCT	2	6	3562	3567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188587530
71	NC_010724	AAAGG	2	10	3582	3591	60 %	0 %	40 %	0 %	188587530
72	NC_010724	AT	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	188587530
73	NC_010724	AAG	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587530
74	NC_010724	TA	3	6	3742	3747	50 %	50 %	0 %	0 %	188587530
75	NC_010724	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587531
76	NC_010724	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587531
77	NC_010724	GGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587531
78	NC_010724	A	6	6	3831	3836	100 %	0 %	0 %	0 %	188587531
79	NC_010724	GGA	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587531
80	NC_010724	A	6	6	3873	3878	100 %	0 %	0 %	0 %	188587531
81	NC_010724	A	6	6	4289	4294	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
82	NC_010724	A	6	6	4317	4322	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
83	NC_010724	TTA	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
84	NC_010724	CAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
85	NC_010724	AGA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587532
86	NC_010724	TAA	2	6	4607	4612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587532
87	NC_010724	A	6	6	4617	4622	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
88	NC_010724	TGGT	2	8	4628	4635	0 %	50 %	50 %	0 %	188587532
89	NC_010724	ATAAA	2	10	4747	4756	80 %	20 %	0 %	0 %	188587532
90	NC_010724	A	6	6	4754	4759	100 %	0 %	0 %	0 %	188587532
91	NC_010724	CAA	2	6	4785	4790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
92	NC_010724	TCA	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587532
93	NC_010724	AG	3	6	4982	4987	50 %	0 %	50 %	0 %	188587532
94	NC_010724	ATT	2	6	4996	5001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
95	NC_010724	TTTA	2	8	5058	5065	25 %	75 %	0 %	0 %	188587532
96	NC_010724	TA	3	6	5112	5117	50 %	50 %	0 %	0 %	188587532
97	NC_010724	AAC	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
98	NC_010724	GGT	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587532
99	NC_010724	TAA	2	6	5294	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587532
100	NC_010724	TAT	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587532
101	NC_010724	AAC	2	6	5349	5354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587532
102	NC_010724	AGG	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587532
103	NC_010724	TCA	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587533
104	NC_010724	ATT	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
105	NC_010724	A	7	7	5952	5958	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
106	NC_010724	AAC	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587533
107	NC_010724	TAT	2	6	6028	6033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
108	NC_010724	TCA	2	6	6066	6071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587533
109	NC_010724	GAA	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
110	NC_010724	T	6	6	6173	6178	0 %	100 %	0 %	0 %	188587533
111	NC_010724	A	6	6	6270	6275	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
112	NC_010724	TA	3	6	6300	6305	50 %	50 %	0 %	0 %	188587533
113	NC_010724	TCAA	2	8	6351	6358	50 %	25 %	0 %	25 %	188587533
114	NC_010724	TTC	2	6	6359	6364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188587533
115	NC_010724	A	7	7	6386	6392	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
116	NC_010724	A	6	6	6493	6498	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
117	NC_010724	AGA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
118	NC_010724	TAA	2	6	6519	6524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587533
119	NC_010724	AAAT	2	8	6534	6541	75 %	25 %	0 %	0 %	188587533
120	NC_010724	A	6	6	6550	6555	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
121	NC_010724	ATT	2	6	6654	6659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
122	NC_010724	A	6	6	6681	6686	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
123	NC_010724	GAA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
124	NC_010724	CTG	2	6	6818	6823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188587533
125	NC_010724	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587533
126	NC_010724	AAC	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188587533
127	NC_010724	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
128	NC_010724	GAA	2	6	6892	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
129	NC_010724	CGG	2	6	6904	6909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188587533
130	NC_010724	AAG	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587533
131	NC_010724	GAAAAA	2	12	6958	6969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188587533
132	NC_010724	A	6	6	6997	7002	100 %	0 %	0 %	0 %	188587533
133	NC_010724	GGA	2	6	7095	7100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188587533
134	NC_010724	TAAA	2	8	7113	7120	75 %	25 %	0 %	0 %	188587533
135	NC_010724	ATT	2	6	7164	7169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188587534
136	NC_010724	A	6	6	7178	7183	100 %	0 %	0 %	0 %	188587534
137	NC_010724	CTA	2	6	7248	7253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
138	NC_010724	CAT	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
139	NC_010724	GGGAA	2	10	7306	7315	40 %	0 %	60 %	0 %	188587534
140	NC_010724	TGT	2	6	7336	7341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188587534
141	NC_010724	ATC	2	6	7360	7365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
142	NC_010724	TGG	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188587534
143	NC_010724	A	7	7	7399	7405	100 %	0 %	0 %	0 %	188587534
144	NC_010724	GAA	2	6	7408	7413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587534
145	NC_010724	ATA	2	6	7434	7439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587534
146	NC_010724	TA	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	188587534
147	NC_010724	TAA	2	6	7509	7514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587534
148	NC_010724	TAAG	2	8	7530	7537	50 %	25 %	25 %	0 %	188587534
149	NC_010724	AAT	2	6	7543	7548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188587534
150	NC_010724	TAC	2	6	7578	7583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188587534
151	NC_010724	GAA	2	6	7592	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188587534
152	NC_010724	A	6	6	7614	7619	100 %	0 %	0 %	0 %	188587534
153	NC_010724	A	7	7	8183	8189	100 %	0 %	0 %	0 %	188587535
154	NC_010724	AACT	2	8	8217	8224	50 %	25 %	0 %	25 %	188587535
155	NC_010724	TAGTA	2	10	8227	8236	40 %	40 %	20 %	0 %	188587535
156	NC_010724	G	6	6	8270	8275	0 %	0 %	100 %	0 %	188587535
157	NC_010724	CAAAA	2	10	8289	8298	80 %	0 %	0 %	20 %	188587535

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.